當超濾膜在運用時，因為其對水或溶液中細菌、微生物、膠體、懸浮性固體及可溶性高分子化合物具有較高的截留作用，堆積于膜外表構成污染，使膜的透過功能和截留功能惡化。此外細菌、微生物的附著，其代謝產品在膜外表構成黏液。這些要素都將導致超濾膜功能下降。因此，有必要依據超濾過濾的客觀規律運轉，使超濾處于較佳作業狀況。
　　超濾膜設備的挑選實踐證明，超濾膜能截留大部分溶質，因此有必要在錯流狀況下作業，即原水沿膜外表切向活動，被截留溶質切向流過膜外表，構成濃縮液而排出，因此在正常操作情況下有必要不斷排放濃縮液。一般排放量約占原水的10%，此種操作膜外表流速低于0.1m/s，特別是透水量較高的膜，溶質更多的截留于膜外表，阻塞幾乎是不可避免的。為此有必要添加濃縮液的排放量達原液的50%以上。為使原液的充沛的運用，進口超濾膜設備應設循環體系，排放液可從頭回入原水容器內，少數拋棄排放。添加循環泵的流量，恰當加大濃縮液排放管道直徑是必要的。
　　為有利于超濾膜的再生，設備有必要選用反沖刷體系，選用兩組膜組合運用，替換反沖刷，運用超濾液直接反沖的辦法，削減膜的污染并有利于反沖刷壓力的操控。例如作業10min，反沖刷0.5min，反沖液悉數排放。如此操作操控排放量亦僅在10%左右。這種辦法突破了膜污染后再沖刷的傳統方法，能確保體系一直處在高通量狀況下作業。此外，還應設制快速等壓沖刷體系，即封閉超濾液出口，全開濃縮液排放閥，在低壓下泵以全流量經過膜外表完成快速沖刷，對康復膜的功能有較大的作用。
　　進口超濾膜設備頻頻的反沖刷與等壓沖刷，有必要有自動操控體系予以確保，不然操作的一次失誤解形成體系的損壞。超濾設備因為膜的結構、規劃、操作是確保膜元件長時間運轉的重要的要素。