超濾膜作為污水處理設備，在長期運轉下，會逐步構成凝膠層和污染物沉積積層，并在壓力差的作用下漸漸被壓實，使流體阻力明顯添加，透水通量急劇下降。所以超濾膜要定時清洗，以確保超濾膜的慣例運用的壽數。以下是幾個整理超濾膜的辦法：
　　物理辦法：
　　1、逆向沖刷。用原水沖刷超濾膜內和進水端面的雜質。
　　2、反沖刷。用超濾水從膜塊外表的污染物沖松懈、脫落，分別從進水口和濃縮口排出(可加酸、堿或次氯酸鈉等藥品加強清洗作用)。
　　3、正沖刷。用原水沖刷超濾膜內和端面的雜質，按運轉狀況將超濾膜清洗潔凈。
　　化學辦法：
　　1、用酸液沖刷。
　　2、選用氟化氫鈉和堿的混合洗液、氟化氫鈉和酸的混合洗液、或許氟化氫鈉和氟化鈉的混合洗液進行清洗。
　　3、用氧化劑進行清洗。
　　4、選用膜清洗助劑進行清洗。
　　5、選用外表活性劑或有機溶劑清洗劑進行清洗。